Как интегрировать AdminPE в систему взамен обычной среды восстановления (WinRE)?:
Распаковать содержимое загрузочного диска в любую папку на жестком диске.
Перейти в папку AdminPE32/64 (в зависимости, какая у вас система – x86 или x64),
Запустить WinRE32/64.cmd (от имени администратора) и следовать описанию консоли.
P.S.: командный файл создаст папку AdminPE32/64 в корне системного раздела.

Для добавления 32-битных программ в x64 битную систему –
после интеграции x64 битной AdminPE – зайдите в папку AdminPE32 и запустите WinRE.cmd

Распакуйте содержимое загрузочного диска в любую папку на жестком диске.
Перейдите в папку Boot, и запустите AdminPE.cmd
(от имени администратора) и следуйте описанию консоли.
В запросе “это файл (F) или каталог (D)” при копировании BOOTMGR и GRLDR нажимаем “файл (F)“.
Командный файл создаст папки BOOT, AdminPE32, AdminPE64 в корне системного раздела,
и добавит следующие записи в список операционных систем:
Windows XP (boot.ini): GRUB4DOS – через него загружается главное меню AdminPE
Windows 7/8/8.1 (BCD): AdminPE (x86), AdminPE (x64), GRUB4DOS – всего будут созданы 3 записи.
При этом стандартная среда восстановления затронута не будет.
Сборка будет интегрирована без изменения системных файлов, за исключением списка загрузчика ОС.

P.S.: Не запускайте полную интеграцию несколько раз подряд:
каждый раз будут создаваться новые пункты в меню загрузчика операционной системы